图书馆现设六个部门，即办公室、采编部、流通阅览部、期刊部、技术与电子资源服务部、信息咨询与特藏部。
管理机构：

办公室 办公室在馆长领导下处理全馆行政、后勤日常事务。负责上传下达、内外联系、会务管理、接待来访、文书档案、人事档案、借阅证办理等工作。
南校区办公室位于图书馆北座一楼，电话：0898-65882296。
桂林洋校区办公室位于桂林洋校区公共教学楼二楼，电话：0898-65736634。

采编部 位于图书馆南座一楼，有二个主要任务：
一是文献采访。根据本校学科建设、教学和科研需要，搜集采访中外文图书、电子资源等文献资料，补充馆藏。
二是文献整序。按国家标准对入藏的各种文献进行加工整理，使馆藏文献有序化；负责本馆图书、电子资源等文献书目数据库的建设和维护。
电话：0898-65867547

流通阅览部 流通阅览部的主要任务是提供1950年以后入藏的中文图书的外借和阅览服务，提供图书的续借、预约服务和借阅证的挂失、退证工作。
中文图书第一借阅室：位于图书馆北座三楼，收藏2000年以后入藏的社会科学类图书。本室内设新书阅览区，陈列最近入藏的新书、热点书。
中文图书第二借阅室：位于图书馆北座四楼，收藏2000年以后入藏的社会科学类图书和自然科学类中文图书；
中文图书第三借阅室：位于图书馆南座三楼，收藏1986～1999年以前入藏的各类中文图书。
中文图书第四借阅室：位于图书馆北座一楼，收藏1985年以前入藏的各类中文图书和部分赠送图书.
馆际互借服务：在本部各借书台，均可办理海南省高校馆际互际服务的相关事务。
电话：0898-65867674。

期刊部 期刊部的主要任务是根据本校教学和科研需要，搜集采访中外文报纸、期刊，并进行分类编目，提供阅览服务。
现报阅览室：位于图书馆北座九楼，收藏当年订购的中外文报纸。
现刊阅览室：位于图书馆北座九楼，收藏当年订购中外文期刊。
中国人民大学复印资料阅览室：位于图书馆北座九楼，收藏当年、历年出版的中国人民大学专题复印资料。
中文过刊阅览室：位于图书馆南座二楼，收藏解放后的中文期刊合订本。
中文报纸合订本阅览室：位于图书馆北座一楼，收藏历年的中、外文报纸合订本。
电话：0898-65867094。

技术与电子资源服务部 技术与电子资源服务部的主要任务是负责图书馆ILASⅡ系统、设备的维护管理、网络管理和数据库管理；负责电子阅览室工作；提供电子资源阅览服务。第一、二电子阅览室：位于图书馆北座五、六楼，有读者用机430台，可提供目录查询，电子图书、电子期刊、专业数据库、音像资料等电子资源的利用；提供Internet浏览等服务。
电话：0898-65867714。

信息咨询部、特藏部 信息咨询部、特藏部的主要任务是：①文献的阅览和外借服务；②信息咨询服务；③本馆特色资源的开发利用与数字化、网络资源整序与导航；④读者培训。
信息咨询室：位于图书馆北座二楼，开展参考咨询、科技查新、文献传递、代查代检等服务，开展读者培训，以及负责网络资源整序与导航等工作。
工具书检索室：位于图书馆北座七楼，收藏中外文各类工具书，考研信息资料等。
参考书阅览室：位于图书馆北座七楼，收藏中文图书保存本。
古籍阅览室：位于图书馆北座八楼，收藏古籍、特种文献资料（地方志）。
海南文献中心：位于图书馆北座八楼，内设海南文献、海南文学馆、教师科研成果展厅。收藏海南地方文献资料（包括历年报纸、期刊、各类图书）、本校教师科研成果等。
总咨询台：位于本馆北座一楼，受理读者一般咨询问题。
电话：0898-65867099。